《时空来电》主要讲述积案组组长何君（李小冉饰）从职场菜鸟蜕变成飒爽警花，带领以新人刑警顾明哲（王天辰饰）为首的四人破案小组，为寻求积压悬案真相四处奔走，伸张正义的故事。

明末清初，朝廷腐败，义军起义。天地会以“反清复明”为宗旨，救民于水火之中，深为朝廷所忌。而皇叔阿尔泰，则以剿灭天地会为名，串通倭寇，企图谋反。